An der KTF sind zwei Doktoratsbeiräte zur Beratung der Doktoratsstudienprogrammleitung (SPL 60) eingerichtet, ein Beirat für theologische Doktorate und ein weiterer Beirat für religionswissenschaftliche Doktorate. Die Beiratsmitglieder treten je nach fachlichem Schwerpunkt der vorgestellten Dissertationsprojekte in unterschiedlicher Zusammensetzung bei den fakultätsöffentlichen Präsentation zusammen und geben eine Empfehlung für die Studienprogrammleitung ab, ob die Dissertationsprojekte in der präsentierten Form zugelassen werden sollen oder einer weiteren Überarbeitung bedürfen.